W magazynach materiałów sterylnych bądź wydzielonych miejscach, które służą do przechowywania materiałów sterylnych, należy przestrzegać pewnych zasad i przechowywać sterylizowane narzędzia we właściwych warunkach.
Należy wtedy ograniczyć dostęp personelu, czyli mniej osób powinno wchodzić do pomieszczeń magazynowych oraz otwierać szuflady czy szafy.
Trzeba dostosować pomieszczenia, szafy, szuflady do wielkości, ilości i rozmiarów narzędzi po sterylizacji. Należy pamiętać o tym, żeby nie narażać ich na uszkodzenie opakowania. Co więcej, regały i ściany, a także pojemniki powinny zostać wykonane z materiałów, które zapewniają łatwe utrzymanie czystości.
Kolejną rzeczą jest zapewnienie ochrony przed gwałtownymi zmianami temperatury i wilgotności, a także przed zanieczyszczeniem, szkodnikami, promieniowaniem słonecznym, uszkodzeniem mechanicznym i przed innymi czynnikami, które mogą zagrażać ponownemu skażeniu.
W magazynie materiałów sterylnych musi zostać zapewniony odpowiedni poziom wentylacji, który zapewniał będzie co najmniej 4 wymiany powietrza w ciągu godziny. Warto zadbać także o niską wilgotność powietrza na poziomie 30-60 procent oraz stałą temperaturę powietrza.
W magazynie materiałów sterylnych istnieje konieczność monitorowania warunków atmosferycznych, jeśli chodzi o kontrolę temperatury, wilgotności oraz ciśnienia. Należy to robić w sposób ciągły.